Cytochrome c (cytc) is a protein in our bodies that helps with various cell processes. It contains a part called heme iron that is important for its function. This study investigates the effect of mutations in the Ω-loop region of human cytochrome c (hCytc) on its peroxidase activity, which is related to the initiation of the apoptosis, a process of programmed cell dead. Computer simulations were used to study three different mutations to the Ω-loop of human cytc, specifically at T28C, G34C, and A50C. The results show that the G34C mutation caused the Ω-loop to become more flexible and move further away from the heme iron. In addition, a part of the protein at Arg38 position moved away from the heme iron. The data provide detailed insights into the structural basis of hCytc that could contribute to its pro-apoptotic function.

Cytochrome c หรือ cytc เป็นโปรตีนที่มีอยู่ในร่างกายของเราและช่วยในกระบวนการของเซลล์หลายอย่าง โดยมีส่วนหนึ่งที่เรียกว่าฮีมไอรอน (heme iron) ซึ่งมีความสำคัญต่อฟังก์ชันของโปรตีนนี้ การวิจัยนี้ได้ศึกษาผลของการกลายพันธุ์ ในโซน Ω-loop ของ human cytc (hcytc) ต่อการเร่งปฏิกิริยาเปอร์ออกซิเดซ (peroxidase activity) ซึ่งเกี่ยวข้องกับกระบวนการ ตายของเซลล์ หรือเรียกว่า กระบวนการ apoptosis โดยใช้การคำนวณโครงสร้างของ hcytc ด้วยคอมพิวเตอร์เพื่อศึกษาการ กลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง T28C, G34C, และ A50C พบว่าการกลายพันธุ์ที่ G34C ทำให้โซน Ω-loop เปลี่ยนรูปและเคลื่อนที่ไกลกว่า จากฮีมไอรอนเมื่อเทียบกับโครงสร้างเดิมที่ยังไม่กลายพันธ์ นอกจากนี้ ส่วนหนึ่งของโปรตีนที่ตำแหน่ง Arg38 ยังเคลื่อนที่ออกจาก ฮีมไอรอนด้วย ผลการวิจัยเหล่านี้ให้ทราบรายละเอียดของโครงสร้างของ hcytc ซึ่งอาจมีส่วนช่วยในการเข้าใจกลไกเริ่มต้นของ กระบวนการการตายของเซลล์